Chaque année, entre juin et septembre, plus de 35 000 baleines à bosse passent à moins de cinq milles marins du cap lors de leur voyage annuel vers le nord, depuis leurs zones d'alimentation de l'Antarctique vers les eaux de reproduction tropicales près de la côte de Kimberley. La population de la ville passe de moins de 1 200 résidents permanents à plus de 8 000 pendant la haute saison, attirée par des observations que les biologistes marins décrivent comme parmi les plus prévisibles des eaux australiennes.
Le décrochage profond du plateau continental se situe à seulement trois kilomètres de la côte, créant des zones d'upwelling riches en krill et en petits poissons qui attirent non seulement les baleines à bosse, mais aussi les baleines franches australes, les baleines bleues et, occasionnellement, des groupes d'orques. Naturaliste Charters, qui opère depuis 1996 dans le cadre des directives sur l'observation des baleines et des dauphins du Commonwealth, gère une flotte de catamarans spécialement conçus à cet effet et équipés de hydrophones qui diffusent en temps réel les vocalisations sous-marines des baleines. L'entreprise détient la certification Advanced Ecotourism d'Ecotourism Australia, une désignation attribuée à moins de trente opérateurs maritimes dans tout le pays. Des biologistes marins à bord assurent l'identification des espèces et l'interprétation des comportements, en notant les séquences de sauts (breaches), les battements de nageoires pectorales et les schémas de remontée synchronisés qui signalent la cohésion du groupe.
Les excursions d'observation des baleines à Augusta partent du port de plaisance sur Leeuwin Road, un bras de mer abrité dragué en 1962 pour desservir les industries du bois et de la pêche de la région. Le port fonctionne aujourd'hui principalement comme un pôle d'excursions, avec des départs le matin et l'après-midi programmés pour coïncider avec les échanges de marée qui concentrent les poissons-appâts le long de la bordure du plateau. Chaque voyage de trois heures couvre environ quarante kilomètres, se dirigeant vers le nord le long du couloir de Flinders Bay avant de revenir en contournant le système de récifs de Hamelin Bay. Les observations ont lieu sur plus de quatre-vingt-quinze pour cent des départs saisonniers, le mois d'août représentant le pic statistique alors que les paires mère-veau empruntent la route côtière peu profonde.
La région plus large de Cape to Cape, qui s'étend sur 135 kilomètres du cap Naturaliste au cap Leeuwin, a été désignée parc marin en 2004, imposant des distances d'approche strictes et des zones de navigation sans sillage autour des regroupements de cétacés. Les navires doivent rester à au moins 100 mètres des baleines adultes et à 200 mètres des baleineaux, avec les moteurs au point mort lors des rencontres rapprochées. Ces réglementations, appliquées par le Department of Biodiversity, Conservation and Attractions, ont maintenu de faibles niveaux de perturbation, alors même que le nombre de visiteurs a triplé depuis 2010. La saison d'observation des baleines d'Augusta s'aligne précisément sur la fenêtre de migration australe, ce qui la distingue de la saison de mise bas plus tardive de Hervey Bay et de la route de retour printanière de Sydney.
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